تعیین توالی کامل جدایه ایرانی ویروس موزاییک چغندرقند

Authors

Abstract:

ویروس موزاییک چغندر (Beet mosaic virus, BtMV)، تنها پوتی‌ویروس آلوده‌کننده چغندرقند بوده و امروزه در سراسر چغندرکاری‌های جهان پراکنش دارد. در مطالعه حاضر ژنوم کامل جدایه‌ای از این ویروس (Ir-VRU) با استفاده از آغازگرهای دژنره عمومی پوتی‌ویروس‌ها، آغازگرهای اختصاصی طراحی شده و همچنین روش 5'-RACE برای اولین بار در ایران توالی یابی شد. ژنوم کامل جدایه ایرانی BtMV، بدون در نظر گرفتن دنباله poly-A، 9591 باز طول داشته، و بخش‌های 5'-UTR و 3'-UTR به ترتیب 165 و 168 باز می‌باشند. موتیف‌های معمول، چارچوب ژنی پلی‌پروتئین و PIPO در این جدایه شناسایی گردید. کد شدن پلی‌پروتئینی به طول 3086 آمینواسید و نه جایگاه برش در این پلی‌پروتئین پیش بینی گردید. بربررسی‌ها بر روی پنج جدایه مختلف BtMV نشان داد که جدایه ایرانی یکسانی زیادی به دو جدایه آلمانی و چینی داشته و از طرف دیگر بیشترین تفاوت را با جدایه آمریکایی نشان می‌دهد. تحلیل تبارزائی نیز جدایه Ir-VRU را به‌عنوان یک عضو از سوپر گروه BCMV نشان می‌دهد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

واکنش ارقام کلزا به جدایه ویروس موزاییک کلم گل و آلودگی همزمان با جدایه های ویروس موزاییک شلغم و موزاییک کلم گل در شرایط گلخانه

گسترش سطح زیرکشت کلزا (Brassica napus L.) در جهان نشانگر اهمیت این گیاه می‌باشد. از 12 ویروس گزارش شده از کلزا، ویروس موزاییک کلم‌گل (Cauliflower mosaic virus, CaMV) و ویروس موزاییک شلغم (Turnip mosaic virus, TuMV) دارای اهمیت ویژه‌ای می‌باشند. استفاده از ارقام مقاوم یکی از راه‌کارهای مناسب برای کنترل خسارت بیماری‌های ویروسی محسوب می‌شود و از طرفی تاکنون ارزیابی ارقام تجاری کلزا در ایران در برا...

full text

بررسی اتیولوژی و مولکولی یک جدایه ایرانی ویروس موزاییک کدو

بدشکلی و موزائیک معمول ترین علائم بیماری های ویروسی کدوئیان در مزارع استان یزد است. در طی نمونه برداری از مزارع استان یزد در سال 91-1390 یک نمونه طالبی با علائم موزائیک جمع آوری گردید .به منظور تعیین آلودگی ویروسی نمونه فوق از آزمون الایزای غیر مستقیم و آنتی سرم ویروس های گزارش شده در کدوئیان (ویروس موزاییک هندوانه، ویروس موزاییک خیار، ویروس موزاییک زرد کدو و ویروس موزاییک کدو) استفاده گردید که...

15 صفحه اول

تعیین ترادف نوکلئوتیدی کامل ژنوم ویروس موزاییک کوتولگی ذرت (mdmv)

ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (maize dwarf mosaic virus, mdmv) از نظر اقتصادی در سطح جهانی یکی از مهم ترین ویروس های ذرت به شمار می آید. در ایران نیز این ویروس از اهمیت زیادی برخوردار است. هدف از انجام این تحقیق تعیین ترادف کامل ژنوم ویروس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده و مقایسه آن با سایر ترادف های پوتی ویروسهای گرامینه موجود در بانک ژن بود. پس از انجام rt-pcr قطعات بدست آمده همسانه ساز...

15 صفحه اول

خالص‌سازی و تولید آنتی‌سرم جدایه ایرانی ویروس زردی نکروتیک رگبرگ چغندرقند عامل بیماری ریزومانیا

ویروس زردی نکروتیک رگبرگ چغندر قند (Beet necrotic yellow vein virus) عامل بیماری مهم ریشه‌گنایی یا ریزومانیا (Rhizomania) در چغندرقند است. در تحقیق حاضر طی سال 1384 در شیراز، به‌منظور استفاده‌ از روش‌های سرولوژیکی (ازجمله آزمون الیزا) در تشخیص بیماری و نیز استفاده‌از این روش‌ها در برنامه‪های اصلاحی چغندرقند جهت انتخاب ژرم‌پلاسم متحمل به بیماری، جدایه ایرانی ویروس مذکور خالص‌سازی و آنتی‌بادی علی...

full text

مقایسه برخی جدایه های ویروس موزاییک ایرانی ذرت با استفاده از توالی یابی ژن کدکننده نوکلئو کپسید پروتیین

ذرت در کنار گندم و برنج، یکی از سه محصول غله بسیار مهم جهان است و به عنوان یک محصول استراتژیک سطح زیر کشت و تولید آن در جهان و ایران رو به گسترش است. ویروس موزاییک ایرانی ذرت iranian maize mosaic virus (immv) از جنس nucleorhabdovirus و خانواده rhabdoviridae، اولین بار در سال 1347 در یک مزرعه ذرت در استان فارس مشاهده شد. دامنه میزبانی این ویروس محدود به خانواده گرامینه بوده و یکی از ویروس های مخ...

تعیین ترادف شش جدایه ایرانی ویروس موزائیک هندوانه و مقایسه فیلوژنتیکی جدایه های ایران با سایر جدایه های دنیا

ویروس موزائیک هندوانه(Watermelon mosaic virus, WMV) یکی از  پوتی ویروس های مهم و گسترده در دنیا است که به کدوئیان خسارت وارد می کند. به منظور ردیابی وتعیین پراکنش این ویروس در مزارع استان گلستان179 نمونه از گیاهان دارای علائم موزائیک کدو، هندوانه، خربزه و خیار از شش منطقه از استان گلستان جمع آوری و با آنتی سرم WMV</stro...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 55  issue 4

pages  339- 351

publication date 2020-12-21

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023